13/09/2012
Projektowanie leków w oparciu o strukturę receptora – teoria i praktyka
Celem kursu jest dostarczenie uczestnikom podstawowej wiedzy z modelowania komputerowego w zakresie projektowania nowych leków. Po zakończeniu szkolenia uczestniczy zdobędą zasadniczą wiedzę z zakresu bioinformatyki farmaceutycznej oraz umiejętności modelowania oddziaływań białko-ligand za pomocą przykładowych narzędzi bioinformatycznych.
Data: 25 września 2012 (wtorek)
Miejsce: Sala S2, Wydział Biologii UAM, ul. Umultowska 89, Poznań
Czas trwania: 7 godzin (9-16)
Cena szkolenia: 1000 zł brutto.
W cenie: materiały szkoleniowe, obiad, przerwy kawowe
Szczegóły na stronie http://oiola.com/e/974-szkolenie-projektowanie-lekow-w-oparciu-o-strukture-receptora-teoria/
Plan szkolenia
- Projektowanie leków in silico – wprowadzenie
Wstęp do wspomaganego komputerowo projektowania leków, porównanie tradycyjnego eksperymentalnego podejścia tworzenia nowych leków z metodami bazującymi na modelowaniu komputerowym
- Projektowanie leków jako metoda knowledge-based
Przedstawienie podstawowych metod projektowania leków in silico wykorzystujących informacje o znanych inhibitorach enzymatycznych (podejście ligand-based) lub dostępnej strukturze receptora (podejście structure-based)
- Biocząsteczki w trójwymiarze
Zapoznanie z bazami struktur biologicznych (Protein Data Bank, PDBe, PDBj) oraz bazami małych związków chemicznych (ZINC, PubChem, BindingDB), użycie przeglądarki struktur biologicznych i manipulacja strukturą 3D białka (PyMOL, Chimera)
- Dokowanie małych związków chemicznych do struktury receptora
Wprowadzenie do dokowania molekularnego jako szeroko stosowanej metody projektowania leków opartej na strukturze receptora, dokowanie step by step, przykłady algorytmów dokowania, przykładowe funkcje oceny oddziaływania ligand-receptor, użycie programu do dokowania molekularnego (PLANTS)
- Wirtualne badania przesiewowe
Zastosowanie wirtualnych badań przesiewowych w przemyśle farmaceutycznym, trudności i sukcesy w badaniach wysokoprzepustowych