Szkolenie ''Wprowadzenie do modelowania struktury białek'' w najbliższą środę

Program szkolenia

„Wprowadzenie do modelowania struktury białek”

organizowanego przez VitaInSilica

Termin – 13.07.2011

Miejsce – Nickel Technology Park

Czas – 10.00 – 15.00, w tym przerwa na lunch

I. Część teoretyczna – 1 - 1,5h

1. Wprowadzenie do struktury białek:

• Powiązanie struktury z funkcją

• Do czego służą modele białek?

2. Wprowadzenie do białkowych baz danych:

• Protein Data Bank (PDB)

• Bazy danych CATH i SCOP do klasyfikacji struktur

3. Główne strategie modelowania:

• Modelowanie de novo

• Modelowanie homologiczne

4. Metaserwer – pomoc przy przewidywaniu struktury przestrzennej białek.

5. Ocena modeli.

6. Narzędzia do wizualizacji modeli strukturalnych.

II. Część praktyczna (modelowanie homologiczne) – 3h

1. Opis wybranego celu modelowania.

2. Wybór szablonu.

3. Stworzenie przyrównania szablon – cel.

4. Modelowanie.

5. Ocena i optymalizacja modelu.